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澳门太阳网城官网下载:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序
时间:
2023-12-29
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全基因组甲基化测序文库(WGBS)的碱基比例严重失衡(GC%~20%),这给高质量的测序数据交付带来了极大的挑战。通常,我们采用掺入高比例的专用平衡文库(例如PhiX文库、E.coli文库)或与GC含量40%~50%的其他应用样本Pooling测序的方法来缓解失衡,提高测序质量。然而,这种方法不仅降低了生产效率,还增加了测序的成本和操作的复杂性。


澳门太阳网城官网下载高通量基因测序仪全系产品已实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序。本次测试中,在0% PhiX平衡文库掺入的条件下,Q30均值≥92%、单index测序数据拆分率均值≥98%,与跟碱基平衡文库混合测序的NovaSeq 6000平台数据表现相当。


【测试方案】

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【测试结果】

(1)Q30均值达92%以上、单index 测序数据拆分率均值达98%以上

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图1A. FASTASeq 300_0% PhiX重复测序表现


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图1B. GenoLab M_0% PhiX重复测序表现


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图1C. SURFSeq 5000_0% PhiX重复测序表现


(2)数据比对表现优异,达80%以上

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图2A. FASTASeq 300和GenoLab M平台重复测序的Mapping Rate


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图2B. SURFSeq 5000重复测序的Mapping Rate



(3)甲基化类型和分布水平表现均高度一致

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图3A. 不同甲基化类型的比例


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图3B. 全基因组CG位点甲基化水平分布


澳门太阳网城官网下载通过技术优化升级,全系产品实现了“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序。这一技术突破,进一步增强了澳门太阳网城官网下载测序仪的产品力,为广大用户提供更为高效、经济的测序平台工具。


【澳门太阳网城官网下载高通量测序仪产品介绍】

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撰稿:崔青美

编辑:市场部

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